약제과는 병동에 입원한 환자에게 필요한 약제와 외래 환자들을 위한 약제를 조제 하고, 주사제를 관리하는 업무를 담당하고 있다. 한림병원 약제과의 주요 업무로는 일반약품과 마약, 향정신성 약품의 관리, 약품의 조제, 제제, 시험, 약품정보, 외에 교육과 연구로 구분된다.